《组合怪物》有着一个完全开放性的地图，玩家在当中探索将与会遇到各种呆萌有趣的妖精生物。为了消灭这些挡路的怪物，玩家需要在一个方格状的“培养基”中将各种不同的怪物基因结合在一起，制造出能力大小、不同的妖精生物与之对抗。
最初，游戏的组合玩法与战斗玩法是分开来的，但开发者认为将二者融合在一起将会创造一款更刺激，更具有挑战性的游戏。游戏重点在于战斗和收集方面，以及组合不同类型的怪物来创造一个拥有多种混合属性的新怪物。
这个组合方式操作很简单，只需将“培养基”上的怪物移动到另一“培养基”上就可以看到它们融合成一个新的生物体，若继续这样的操作，就可制造出体型更巨大，能力更多样的新品种。最后再把完成品移动到地面上，欣赏它们对敌人的精彩对决即可。
